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Genética Populacional: Bioconductor
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Bioconductor fornece ferramentas para a análise e compreensão dos dados genômicos de alto rendimento. Bioconductor usa a linguagem de programação estatística R, e é open source e desenvolvimento aberto. Ele tem duas versões a cada ano, 934 software packages. E uma comunidade de usuários ativos. Bioconductor também está disponível como Amazon Machine Image (AMI). Clique aqui para acessar a página do programa. Postado por Miklos Bajay. Compartilhar com o Pinterest. PhD em genética (USP).
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Genética Populacional: FAMD
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Fingerprint Analysis with Missing Data (FAMD) é uma pequeno programa que aborda resoluções de problemas com dados faltantes em dados domindantes provindo de marcadores como AFLP, RAPD, ISSRs. Aguns dos objetivos do programa são:. Cálculo da similaridade (des) mínima / máxima / média de Jaccard, Dice, Nei e euclidiana. Produção de matrizes de distância. Estimativa do índice de Shannon por bootstrapping. UPGMA, NJ e as árvores de consenso estrito. AMOVA para todas as medidas implementadas (dis) similaridade.
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.:.Vídeos Bio.:.: Jethro Tull - J.S.Bach - Bouree
http://videosbio.blogspot.com/2011/08/jethro-tull-jsbach-bouree.html
Biological Videos and Music. Jethro Tull - J.S.Bach - Bouree. Postado por Miklos Bajay. Master and PhD in Genetic (USP -ESALQ). Laboratory of Genetic Diversity and Breeding. There was an error in this gadget. All videos are free on the Web. Template images by TommyIX.
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Genética Populacional: :::Spatial Genetic Software (SGS):::
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Spatial Genetic Software (SGS): :. O programa Spatial Genetic Software (SGS), prevê ao usuário de Windows uma. Analisar em pequenas e em grande escala, as estruturas genéticas e fenotípicas das populações. O programa pode lidar com. Quase todos os tipos de dados genéticos, tais como. Microssatélites), marcadores dominantes (RAPDs, AFLPs) e marcadores citoplasmáticos. Os dados podem ser analisados como indivíduo. De uma população (escala local) e como dados das frequências dos alelos ou haplótipos para as.
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Genética Populacional: MICRO-Checker
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MICRO-Checker é um pacote de software baseado em Windows que testa a genotipagem de dados de microssatélites de populações diplóides. O programa auxilia a identificação de erros de genotipagem diferentes, e pode também detectar erros tipográficas. MICRO-Checker estima a frequência de alelos nulos. MICRO-CHECKER também pode ajustar as frequências. Alélicas e genotípicas em função da presença de alelos nulos. Click aqui para acessar a página de download. Postado por Miklos Bajay. PhD em genética (USP).
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Genética Populacional: :::Darwin:::
http://geneticapopulacional.blogspot.com/2012/07/darwin.html
Darwin é um pacote de software desenvolvido para a análise de. Várias funções estão disponíveis para inferir e transformar as matrizes de dissimilaridade a partir de sequências nucleotídicas, marcadores moleculares, caracteres qualitativos ou. Algoritmos diferentes são implementados para realizar análises fatoriais e para a construção de árvores, para avaliar a sua confiabilidade ou para comparar várias árvores no mesmo conjunto de dados. Click aqui para acessar a página de download. PhD em genética (USP).
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::::::-Primer design-::::::: ...TGGE-Star...
http://primerssr.blogspot.com/2011/04/tgge-star.html
Primer design-: : :. We offer high quality SSR primer design service for genetic applications at low cost. We also accept projects involving partnerships in population/conservation genetics. Contact us! Postado por Miklos Bajay. PhD in Genetic ( USP -ESALQ. Laboratory of Genetic Diversity and Breeding. The Cabreúva tree, *Myroxylon peruiferum*, is an endangered tropical species from Brazil used in forest restoration projects. It is known for its medicinal. Template images by mammuth.
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Genética Populacional: Power Core
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Programa de aplicação da estratégia de M avançado com uma busca heurística para estabelecer coleções núcleo contendo o menor número de acessos do germoplasma que mantém a diversidade de todo o banco, considerando dados moleculares e agromorfológicos. Clique aqui para acessar a página de download. Postado por Miklos Bajay. Compartilhar com o Pinterest. PhD em genética (USP). Consultoria ou colaboração para o desenvolvimento de artigos científicos. PCA, PCoA, DAPC e dendrogramas (R).
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Genética Populacional: HIERFSTAT
http://geneticapopulacional.blogspot.com/2014/03/hierfstat.html
HIERFSTAT é um pacote para R permitindo estimar F-estatísticas e componentes de variância com os métodos de momentos para qualquer número de níveis em uma hierarquia. O pacote também permite testar a significância da diferenciação população que utiliza a probabilidade relação G-estatística ou os componentes de variância. Clique aqui para acessar a página de download. Postado por Miklos Bajay. Compartilhar com o Pinterest. PhD em genética (USP). PCA, PCoA, DAPC e dendrogramas (R).
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Genética Populacional: PGDSpider
http://geneticapopulacional.blogspot.com/2014/11/pgdspider.html
Uma ferramenta de conversão automática de dados para softwares de genética de populações e programas de genômica. Clique aqui para acessar a página do programa. Postado por Miklos Bajay. Compartilhar com o Pinterest. PhD em genética (USP). Entre em contato pelo e-mail se precisar de análise estatística dos dados em sua pesquisa para publicação. Todos os gráficos feitos no pacote ggplot2 do R em alta resolução (maior que 600 DPI). Consultoria ou colaboração para o desenvolvimento de artigos científicos.
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