nextgenseq.blogspot.com
Next-Gen Sequencing: Software
http://nextgenseq.blogspot.com/2008/10/software.html
A working guide to the rapidly developing world of Next-Generation DNA sequencing, with an emphasis on bioinformatics. Oct 19, 2008. Software for basic next-gen sequencing operations. Each of the commercial vendors has their own proprietary software, so we will emphasize the open source. A great page about Next-Gen software on SeqAnswers. Alternative base calling for 454 sequencer with improved quality scores. Developed by the Marth lab at Boston College. Alignment to a Reference Sequence. D Hernandez, P...
yichuanliu.blogspot.com
Yichuan's work journal: November 2010
http://yichuanliu.blogspot.com/2010_11_01_archive.html
The scentific works of Yichuan for Bioinformatics/Computational Biology. Tuesday, November 30, 2010. Alternative splicing discovery from RNA-seq. After tons of different method, either .wig file from TOPHAT or .pileup from SAMTOOLs will solve the problem. Interesting thing is the data in these two kind of files are not consist with each other, however, the UCSC genome brower use .wig as the visuzalition. Some example of new alternative splicing:. Subscribe to: Posts (Atom). View my complete profile.
grouthbio.com
Lists of Genomics Software/Service Providers
http://www.grouthbio.com/Genome_Software_Service.php
By Geoffrey Routh, Ph.D). Lists of Genomics Software/Service Providers. Thank you for dropping by! As there is a lot going on in the fields of genomics and bioinformatics, I've created this page as a directory of bioinformatics software developers, genomics service providers, and related useful websites. I update the page at least once per month in an effort to keep it current. Email me if you know of a company that should be listed here, or would like to recommend edits/updates. Website devoted to RNAseq.
lc-bio.com
lncRNA测序 - 高通量测序 - 联川生物
http://www.lc-bio.com/product/show/124.aspx
在最近十余年的生命科学研究中,对具有重要调控功能的非编码RNA的研究可谓是其中最引人关注的领域之一,而长链非编码RNA long non-coding RNAs,lncRNAs 一经登场,便迅速成为非编码RNA界又一个耀眼的明星。 长链非编码RNA lncRNAs 已被证明在不同的生物过程 涉及复杂的机制 中发挥重要的调控作用。 Yang X. et al. Long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and migration in oesophageal adenocarcinoma cells. 2013 Sep 2. doi: 10.1136/gutjnl-2013-305266. Zhou QK. Long noncoding RNAs responsive to. DOI: 10.1111/nph.12537. 100 200 ng/ μ. 07 某些来源样本 如体液样本,昆虫样本,水生生物样本等 无.
estudarcomputacao.com
Estudar Computação: Sorteio do livro "Python para desenvolvedores", da Editora Novatec
http://www.estudarcomputacao.com/2014/10/sorteio-do-livro-python-para.html
Blog sobre o estudo da Ciência da Computação, pra quem gosta de pesquisar e aprender por conta própria. Quinta-feira, 30 de outubro de 2014. Sorteio do livro "Python para desenvolvedores", da Editora Novatec. Lançado o livro Python para Desenvolvedores, um curso rápido e prático sobre o assunto. A Novatec traz mais um título de Python repleto de exemplos para desenvolvedores. O livro Python para Desenvolvedores. Lançado pela Novatec Editora, descreve os principais recursos da linguagem Python, focado em ...
estudarcomputacao.com
Estudar Computação: Startup americana propõe soluções para desenvolvedores
http://www.estudarcomputacao.com/2015/02/startup-americana-propoe-solucoes-para.html
Blog sobre o estudo da Ciência da Computação, pra quem gosta de pesquisar e aprender por conta própria. Quarta-feira, 4 de fevereiro de 2015. Startup americana propõe soluções para desenvolvedores. Com sede em Belo Horizonte, a Appbase promete melhorar o desempenho dos processos de desenvolvimento de aplicativos. Atualmente os fundadores da Appbase. Siddharth Kothari e Sagar Chandarana. Funcionando como uma interface de programação de aplicativos (API), a Appbase. Já que a ferramenta se encarrega de moni...
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