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實驗室裡實驗室外

老學姊突然靈光一閃，說 Let's try to make some Popsicle! 張貼者纖毛蟲於 11:59 下午. 每週四是著名的科學期刊自然 ( Nature. 今年 ( 註這篇是2004年完成的舊文. 發生學 (developmental biology) 現在一般都翻譯成發育生物學，是討論生物從受精卵如何變成個體，包括成長分化衰老死亡這些過程的學問。有一天上課講到了老化，老師說要補充一篇最近剛出爐發表在自然上的綜論文章，報導有關長生不老研究的最新進展。哇，竟然從鯉魚的研究找到了可以影響哺乳動物壽命的關鍵，這真是令人興奮的大發現不過老師說他想找更多的相關研究與原始文獻來補充，但是文後所附的參考文獻台灣都找不到，所以很抱歉，他當前所能告訴我們的就只有這篇自然的報導所述的內容了。不過這個小小的或大大的玩笑卻讓我有一點點警覺平常我們看期刊時，除了與自己專擅與本身研究相關的領域會去找出原始文獻來細讀，其他的新知大都就是這樣看看綜論評述或報導了。去年 ( 註 2003. 英國知名的基因體研究機構也在愚人節時弄了個網頁，說是定序測出了霸王龍 ( T. rex.

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老學姊突然靈光一閃，說 Let's try to make some Popsicle! 張貼者纖毛蟲於 11:59 下午. 每週四是著名的科學期刊自然 ( Nature. 今年 ( 註這篇是2004年完成的舊文. 發生學 (developmental biology) 現在一般都翻譯成發育生物學，是討論生物從受精卵如何變成個體，包括成長分化衰老死亡這些過程的學問。有一天上課講到了老化，老師說要補充一篇最近剛出爐發表在自然上的綜論文章，報導有關長生不老研究的最新進展。哇，竟然從鯉魚的研究找到了可以影響哺乳動物壽命的關鍵，這真是令人興奮的大發現不過老師說他想找更多的相關研究與原始文獻來補充，但是文後所附的參考文獻台灣都找不到，所以很抱歉，他當前所能告訴我們的就只有這篇自然的報導所述的內容了。不過這個小小的或大大的玩笑卻讓我有一點點警覺平常我們看期刊時，除了與自己專擅與本身研究相關的領域會去找出原始文獻來細讀，其他的新知大都就是這樣看看綜論評述或報導了。去年 ( 註 2003. 英國知名的基因體研究機構也在愚人節時弄了個網頁，說是定序測出了霸王龍 ( T. rex.

<META> KEYWORDS

1 實驗室裡實驗室外

2 綠藻枝仔冰

3 到最後要怎麼解決這種技術難題，往往就變成某實驗室的祕技，不為外人所知

4 最近實驗室來了一位訪問學者

5 經過一番討論，我們的構想是這樣的我們先養出一大缸一大缸綠藻

6 接著把細胞分批拿去離心，比較重的細胞會沉在離心管底部，與原本養細胞的液體分離

7 把上面的液體倒掉後，用少量的緩衝液重新把沉在底部的細胞打散，就能濃縮細胞的濃度

8 只要養好細胞、離心、除去液體、冷凍解凍、再去高速離心，這樣就行了

9 很簡單吧

10 當初我們也都這麼想

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實驗室裡實驗室外,綠藻枝仔冰,到最後要怎麼解決這種技術難題，往往就變成某實驗室的祕技，不為外人所知,最近實驗室來了一位訪問學者,經過一番討論，我們的構想是這樣的我們先養出一大缸一大缸綠藻,接著把細胞分批拿去離心，比較重的細胞會沉在離心管底部，與原本養細胞的液體分離,把上面的液體倒掉後，用少量的緩衝液重新把沉在底部的細胞打散，就能濃縮細胞的濃度,只要養好細胞、離心、除去液體、冷凍解凍、再去高速離心，這樣就行了,很簡單吧,當初我們也都這麼想,怎麼辦呢,popsicle,是美國小孩子常吃的冰棒

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老學姊突然靈光一閃，說 Let's try to make some Popsicle! 張貼者纖毛蟲於 11:59 下午. 每週四是著名的科學期刊自然 ( Nature. 今年 ( 註這篇是2004年完成的舊文. 發生學 (developmental biology) 現在一般都翻譯成發育生物學，是討論生物從受精卵如何變成個體，包括成長分化衰老死亡這些過程的學問。有一天上課講到了老化，老師說要補充一篇最近剛出爐發表在自然上的綜論文章，報導有關長生不老研究的最新進展。哇，竟然從鯉魚的研究找到了可以影響哺乳動物壽命的關鍵，這真是令人興奮的大發現不過老師說他想找更多的相關研究與原始文獻來補充，但是文後所附的參考文獻台灣都找不到，所以很抱歉，他當前所能告訴我們的就只有這篇自然的報導所述的內容了。不過這個小小的或大大的玩笑卻讓我有一點點警覺平常我們看期刊時，除了與自己專擅與本身研究相關的領域會去找出原始文獻來細讀，其他的新知大都就是這樣看看綜論評述或報導了。去年 ( 註 2003. 英國知名的基因體研究機構也在愚人節時弄了個網頁，說是定序測出了霸王龍 ( T. rex.

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實驗室裡實驗室外: 邁向人造生命（二）：一步一步走

http://seacity2.blogspot.com/2008/02/blog-post.html

美國馬里蘭州J. Craig Venter Institute (JCVI)的研究人員在老闆Venter的主導下，企圖朝著合成微生物的方向而努力。無中生有去創造很困難，有樣學樣比較簡單，於是JCVI的人員看看自然界活生生的細菌到底有哪些基因，試圖從基因體的定序來著手，解決基本要素有哪些與附加元件是甚麼的問題。但是哪些是不可或缺的，哪些又是可有可無，與維生無關緊要他們下一個研究，就是有系統地把基因逐次剔除掉如果把某個基因弄掉時細菌依然活得好好的，就表示這個基因在當時的培養狀況下並非必要的相反地，如果某個基因被剔除之後細菌就死掉了，這個基因的產物就是負責細菌生長代謝中缺一不可的角色。這種情況下又怎麼知道要去安排利用哪些基因，去從事哪些生化反應呢還是老話一句無中生有創造很困難，有樣學樣比較簡單。他們踏著航海探險時代前人的步伐，追隨達爾文等自然博物學家的腳步想一想電影怒海爭鋒 (Master And Commander) 中那個對於採集紀錄生物興致勃勃的醫生。的最後，原作者 James Shreeve 這樣寫. 張貼者纖毛蟲於 10:59 下午.

2

實驗室裡實驗室外: 纖纖細毛

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而多年前我在課堂上修習細胞生物學時，這些就已經是教科書上的標準教材學過細胞學的人，或許還記得教科書上曾提過纖毛鞭毛的主體是軸絲 (axoneme)，它的橫切面在電子顯微鏡下可見到微管 (microtubule) 構成"9 2"的美麗複雜結構而運動蛋白 dynein 連結相鄰的微管，利用水解ATP的化學能改變運動蛋白的構型，造成微管的相對滑動，而使軸絲彎曲，讓纖毛擺動。另外人們也發現幾乎人體大多數的細胞在分裂完成，進入不再增殖的靜止時期，也會長出一根不會動的纖毛，稱為初級纖毛 (primary cilium)。只是或許纖毛是會動的胞器這種先入為主的觀念已深植人心，而且不會動的與會動的相比，分明就是缺少了某些構造功能，所以推想這些非運動纖毛或許沒什麼大用處，連由Albert與Watson等人所著的聖經級教科書 Molecular Biology of the Cell. 在1994年第三版時就說初級纖毛不具任何已知的功能 ("has no known function")。遠因呢則是起源於有兩條鞭毛的單胞藻衣藻 Chlamydomonas reinhardtti. Once i...

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實驗室裡實驗室外: 邁向人造生命（一）：又見Venter

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上星期在期刊科學 (Science) 的網站上隨便瀏覽剛發表的論文時，注意到來自美國馬里蘭州J. Craig Venter Institute的研究人員發表了一篇文章. 自由時報，或是更聳動的成功合成DNA 人可望取代上帝. 而名列共同作者之一，就是該機構的創辦人，J. Craig Venter。他利用獨創的全基因體散彈槍定序法 (whole genome shotgun sequencing method)就要後來居上，逼迫跨國團隊快馬加鞭，最後兩方言和，同時分別發表成果，完成人類基因體定序。他又去募集其他資金，最後創設了J. Craig Venter Institute (JCVI)，把幾年來成立的組織通通整合起來，自己帶頭當家。侏儸紀公園的劇情與生命會找到出路的印象早已深植人心，人一定不勝天，面對自然與生命應該要謙卑一點。註關於當年Venter演講的內容經過以及其他感想，請參閱解讀人類基因組的人系列. 張貼者纖毛蟲於 9:12 上午. I like this information provided in this article. 訂閱張貼留言 [ Atom.

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實驗室裡實驗室外: PCR之一：不簡單的簡單

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1 ul 10 uM 寡核甘酸#1. 1 ul 10 uM 寡核甘酸#2. 4 ul 25 mM 氯化鎂水溶液. 1 ul 10 mM 去氧核甘三磷酸混合物. 然後同樣的步驟週期重複一次，兩股 DNA再度打開、黏附引子到特定的區域上、聚合延伸，產物就增加為原來的兩倍重複了三十次，產物就拷貝拷貝再拷貝.，大量複製成原來的二的三十次方倍，換算一下大約是原來的1000000000倍。但是問題來了 DNA的聚合酵素是一種蛋白質，就像把生雞蛋煎成荷包蛋，一般的蛋白質在高溫加熱後就變性失去活性了，怎麼能把聚合酵素加熱高溫，而且還要重複同樣的步驟好幾十次 PCR的應用關鍵就在於使用了一種特殊的 Taq聚合酵素。圖片取自Wikipedia，請參見http:/ en.wikipedia.org/wiki/Image:PCR.svg. 張貼者纖毛蟲於 10:47 上午. Http:/ bio-rad.cnpg.com/lsca/videos/ScientistsForBetterPCR/. 原來 denature 翻譯成 "變性" XD. 訂閱張貼留言 [ Atom. 32406;毛蟲.

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實驗室裡實驗室外: 綠藻枝仔冰

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老學姊突然靈光一閃，說 Let's try to make some Popsicle! 張貼者纖毛蟲於 11:59 下午. 你自認外文能力真是不行到底怎樣叫做不行呢有什麼具體的事情嗎如果不方便公開留言，請寄email. 黑我想認識你可以嗎我是可憐的研究生. 我的FB 帳號 jun yi c@hotmail.com. 訂閱張貼留言 [ Atom. 32406;毛蟲. 24858;人節的故事. 32406;毛大會. 32406;纖細毛. 36993;向人造生命（二）：一步一步走. 36993;向人造生命（一）：又見Venter. PCR之二：PCR之歌. PCR之一：不簡單的簡單. 12300;工具組主控基因」？ 39178;綠藻. From 台大動物 to 宜大生機的旅程. The Road Not Taken. The Sky of Gene.

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五月 2010 | PTT 統合生命科學研究院

http://biotech-ptt.blogspot.com/2010_05_01_archive.html

2010年5月14日星期五 By Shih-Chao Lin. 2010年5月11日星期二 By Shih-Chao Lin. 這是一個文筆非常好的部落格，且作者纖毛蟲談論的話題都是發生在他的研究生活周圍，如果你也是一個在實驗室裡夙夜匪懈的工作者，那麼對於纖毛蟲所描述的故事一定會有會心一笑的時候。最新的一篇文章就是上圖的「綠藻枝仔冰」，相信實驗研究者都有同感，明明就是照著期刊上的步驟，卻怎麼也得不到跟期刊上一樣的好結果，其實這些步驟中間或許隱含著許多不為人知的小撇步，就像這個「綠藻枝仔冰」，如果沒有作者親自提點一下，可能做了半年都做不出來任何結果。可惜的是，學術界是如此的競爭，幾乎沒有作者會提供這類在標準文獻之外的小技巧，這不免是種諷刺，也是種人性吧，科學家也是人啊。 2010年5月10日星期一 By Shih-Chao Lin. 12301;網站上的這個YOUTUBE連結不知道有多少人注意到？儘管已經是2008的年的研究了，不過現在看來還是很有趣。 2 An Animal Model of a Behavioral Intervention for Depression. Neuron.

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蔚藍手札: February 2007

http://blueblueseattle.blogspot.com/2007_02_01_archive.html

就把一些關於台灣、安亞伯、西雅圖 and beyond 生活與旅行的想法，自言自語一下，或是說給好朋友聽吧. 記得有天在阿媽爽網站上尋找德國廠牌ECM出的CD，無意間發現照片中那張村莊泡在汪洋中的CD The Weeping Meadow，試聽之下驚為天人，這麼美、這麼哀傷的音樂，是誰的作品啊那一陣子，我曾為了這些ECM出的CD，在舊部落格裡簡短地介紹了當時最愛的前四名， Officium. Chants, Hymns and Dances. 仔細研究之下，The Weeping Meadow是Eleni Karaindrou為希臘籍大導演Theo Angelopoulos所譜寫的電影配樂。他們有長久的合作關係，The Weeping Meadow是最新的一部，是三部曲 Trilogy 中的第一部。除了The Weeping Meadow外，ECM還出了他們早期合作的電影配樂大全Music for Films，其中包括Landscape in the Mists， The Beekeeper和Voyage to Cythera。 Posted by Euphtw @ 1:32:00 AM.

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蔚藍手札: December 2006

http://blueblueseattle.blogspot.com/2006_12_01_archive.html

就把一些關於台灣、安亞伯、西雅圖 and beyond 生活與旅行的想法，自言自語一下，或是說給好朋友聽吧. 與動物相遇手札上一篇 Birding Journal 更多水鳥. Posted by Euphtw @ 4:00:00 PM. 西雅圖手札上一篇西雅圖聖誕燈飾巡禮 Space Needle and Queen Anne Tower. Posted by Euphtw @ 1:34:00 AM. 聖誕節在我家樓下的Magnuson Park，一下認識許多新種，真的得花好幾天慢慢記錄下來呢. 另一個相似種，是體型較小 24公分的Horned Grebe。與動物相遇手札上一篇春天的使者 Red-Winged Blackbird. Posted by Euphtw @ 3:26:00 AM. 與動物相遇手札上一篇候鳥中的小白臉 Common Goldeneye. Posted by Euphtw @ 8:17:00 AM. Posted by Euphtw @ 3:30:00 AM. Posted by Euphtw @ 6:13:00 AM. 28165;晨Amagerf&...

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蔚藍手札: April 2007

http://blueblueseattle.blogspot.com/2007_04_01_archive.html

就把一些關於台灣、安亞伯、西雅圖 and beyond 生活與旅行的想法，自言自語一下，或是說給好朋友聽吧. 在看過南方澳海洋記事後，知道這裡有大型圍網捕鯖魚船隊，也有單打獨鬥的三腳虎漁船，實在很想親眼瞧瞧這些漁船的模樣。 Posted by Euphtw @ 9:09:00 AM. 我們常打趣說，這簡直像是政黨協商，但最後可能會出爾反爾，推翻之前的協定呢玩這個遊戲，心臟真的要很強才行，並要有顆壞心腸呢. 這兩天下來，我們還複習了 Princes of Florence. 我的德國收藏上一篇 Christmas Treasure Hunting Steinbach小裝飾. Posted by Euphtw @ 8:33:00 AM. 有朋自遠方來一個紐約，一個克里夫蘭，所以Taffy B&B又再度開張。在星期五晚上有免費的佛朗明哥音樂會，由西雅圖fusion music團體Children of the Revolution領銜演出。正在好奇Reptile K有沒有來的時候，他也跑進咖啡店裡，問JY是不是就是JY 只怪我放了JY的正面照片在部落格裡過，他已經成為西雅圖名人。

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在大湖邊上

一天又一天，一年又一年。已經告別了大湖區，而太陽下山明早依舊爬上來。 Sunday, March 01, 2015. 珊昨天傍晚把巧虎帶去公園玩，再去吃飯買水果才回家。玩了一下午，累得在娃娃車上睡著了。回到家後一陣子，才想起來原本拿在手上的巧虎不見了。巧虎掉在馬路上了。珊哭得好傷心，要我帶她出去找巧虎。可是已經很晚了，天黑太暗看不見，不能出去找。珊繼續哭，跑到門邊，說要穿鞋子，要搭電梯，要去馬路，要爸爸帶她去找巧虎，要找巧虎. 媽媽說：阿嬤家有兩隻巧虎，我們回雲林外婆家再拿一個給你。珊不要，「我不要兩個巧虎，我要我的巧虎。台南的巧虎。我要去馬路上找巧虎. 拜託，爸爸帶我去找巧虎. 我要找巧虎.」. 媽媽想了一招，告訴珊說因為她帶巧虎出門常常忘記好好照顧巧虎，巧虎生氣跑去外婆家了。我們打電話給他，跟他說要帶他回台南，好不好？啊，其實她都知道－－巧虎沒有生氣跑去外婆家；她的巧虎已經掉在路上，回不來了。她是否還相信我們幫助她脫離當下傷心情緒的那齣戲碼呢？我不知道，但我曉得她已認識到了「失去」，以及接受它。 Friday, February 06, 2015. 回去系館的老地方吃午餐，圍坐在...

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