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系統分類學研究實務 & 系統生物學

他是軟體動物雙殼綱的編輯，當他收到一些稿件使用mirror image來呈現物種的模式標本時，他就有此疑惑，所以想知道其它分類群編輯的看法。當然我們知道許多動物都是兩側對稱生物，但是難道因為是兩側對稱，所以使用mirror image就完全沒有問題嗎？在我看到的回覆意見中，多數的編輯都持反對的意見，理由如下：. 就算是兩側對稱動物，也可能會有不對稱結構，而不對稱結構在兩側對稱動物中所扮演的生理與生態功能一直是一個重大的議題。例如招潮蟹的螯、昆蟲的不對稱生殖器、魚類的不對稱口裂。也就是說，如果因為偷懶，或是為了自以為的畫面完美，而把一側鏡像到另一側來產生對稱影像，是不應該的；. 如果是標本本身破損，就應該忠實呈現破損的樣貌，而不應該為了自以為是的完美，而故意製造出鏡像，這樣反而會誤導讀者，更不要說使用鏡像來呈現原本並不完整的模式標本了；. 在這些狀況下使用鏡像，就涉及操控影像(manipulation of image)，屬於學術道德問題，應該直接退稿。我想要比較兩個物種的XX＜＝＝但比較基礎是什麼呀？ 12288;不行。因為牠們不具有最近的共祖，所以光是這樣比，...菊科植物的棲位繁多&#...

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他是軟體動物雙殼綱的編輯，當他收到一些稿件使用mirror image來呈現物種的模式標本時，他就有此疑惑，所以想知道其它分類群編輯的看法。當然我們知道許多動物都是兩側對稱生物，但是難道因為是兩側對稱，所以使用mirror image就完全沒有問題嗎？在我看到的回覆意見中，多數的編輯都持反對的意見，理由如下：. 就算是兩側對稱動物，也可能會有不對稱結構，而不對稱結構在兩側對稱動物中所扮演的生理與生態功能一直是一個重大的議題。例如招潮蟹的螯、昆蟲的不對稱生殖器、魚類的不對稱口裂。也就是說，如果因為偷懶，或是為了自以為的畫面完美，而把一側鏡像到另一側來產生對稱影像，是不應該的；. 如果是標本本身破損，就應該忠實呈現破損的樣貌，而不應該為了自以為是的完美，而故意製造出鏡像，這樣反而會誤導讀者，更不要說使用鏡像來呈現原本並不完整的模式標本了；. 在這些狀況下使用鏡像，就涉及操控影像(manipulation of image)，屬於學術道德問題，應該直接退稿。我想要比較兩個物種的XX＜＝＝但比較基礎是什麼呀？ 12288;不行。因為牠們不具有最近的共祖，所以光是這樣比&#65292...菊科植物的棲位繁多&#...

<META> KEYWORDS

1 使用鏡像影像投稿是否涉及偽造？

2 張貼者：

3 shen horn yen

4 沒有留言

5 我舉幾個例子來說：

6 分類處理是為了讓分類體系更合理而非製造更多問題

7 除了併系群以外，還可能製造什麼問題？

8 是共有衍徵？還是獨有衍徵？

9 abcde真的沒有基因交流嗎？

10 學術聲望問題：

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使用鏡像影像投稿是否涉及偽造？,張貼者：,shen horn yen,沒有留言,我舉幾個例子來說：,分類處理是為了讓分類體系更合理而非製造更多問題,除了併系群以外，還可能製造什麼問題？,是共有衍徵？還是獨有衍徵？,abcde真的沒有基因交流嗎？,學術聲望問題：,恁北認為,和 circular tree,還是phylogenetic species concept,4 看不出要畫cladogram還是phylogram,另外還有一種示意圖，就好比這個人類的演化圖,混在一起了～,2 sokal的本意是什麼？

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他是軟體動物雙殼綱的編輯，當他收到一些稿件使用mirror image來呈現物種的模式標本時，他就有此疑惑，所以想知道其它分類群編輯的看法。當然我們知道許多動物都是兩側對稱生物，但是難道因為是兩側對稱，所以使用mirror image就完全沒有問題嗎？在我看到的回覆意見中，多數的編輯都持反對的意見，理由如下：. 就算是兩側對稱動物，也可能會有不對稱結構，而不對稱結構在兩側對稱動物中所扮演的生理與生態功能一直是一個重大的議題。例如招潮蟹的螯、昆蟲的不對稱生殖器、魚類的不對稱口裂。也就是說，如果因為偷懶，或是為了自以為的畫面完美，而把一側鏡像到另一側來產生對稱影像，是不應該的；. 如果是標本本身破損，就應該忠實呈現破損的樣貌，而不應該為了自以為是的完美，而故意製造出鏡像，這樣反而會誤導讀者，更不要說使用鏡像來呈現原本並不完整的模式標本了；. 在這些狀況下使用鏡像，就涉及操控影像(manipulation of image)，屬於學術道德問題，應該直接退稿。我想要比較兩個物種的XX＜＝＝但比較基礎是什麼呀？ 12288;不行。因為牠們不具有最近的共祖，所以光是這樣比&#65292...菊科植物的棲位繁多&#...

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系統分類學研究實務 & 系統生物學: 七月 2009

http://systematicbiology.blogspot.com/2009_07_01_archive.html

Are rates of species diversification correlated with rates of morphological evolution? Dean C. Adams, Chelsea M. Berns, Kenneth H. Kozak and John J. Wiens. 作者在此以190個無肺螈科山椒魚物種的形態與親緣關係資料測試此關係。出乎意料地，作者發現物種分化速率與形態分化速率沒有顯著相關，這些快速分化可以與少量的形態改變共同發生，反之亦然。作者也發現大多數支系發生明顯相似的形態演化(雖然廣泛的共域)，且那些相對較新的表型並未與快速演化相關。最後，作者發現體型和形狀的演化之間有強烈的關係，此關係在前人研究中並未驗證過。訂閱：文章 (Atom). 系統分類學實務 (Practices of Systematic Research). 系統生物學 (Systematic Biology) (大學部課程). Journal (Methodology and Research Trends). Journal of Molecular Evolution.

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系統分類學研究實務 & 系統生物學: 十月 2009

http://systematicbiology.blogspot.com/2009_10_01_archive.html

書名] Species Concepts and Phylogenetic Theory: A Debate. 作者] Quentin D. Wheeler and Rudolf Meier (eds.). 出版單位] Columbia University Press, New York, New York. 規格] 98 x 6.9 x 0.6 inches. 230 p. ISBN] ISBN 0-231-10142-2 (cloth), 0-231-10143-0 (paperback). Phylogenetic Systematics之後，親緣關係研究便以前所未有的速度改變了系統學者與分類學者的研究工作，無論是在假說或分類上的品質、或是在生物學上的應用。由於物種的概念對於生物學的研究、尤其是一般系統學或親緣系統學而言相當關鍵，種概念與深奧的親緣關係理論能否相互呼應便格外重要。隨著對於近幾十年來生物滅絕的關注，世界各地都在進行生物多樣性的調查、比較與保育等等&#652...2生物種概念 (by Ernst Mayr. Mishler 和 Theriot 所認定的. 世界上所擁有的物種數量遠大...

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系統分類學研究實務 & 系統生物學: 我想要比較兩個物種的XX＜＝＝但比較基礎是什麼呀？

http://systematicbiology.blogspot.com/2015/07/xx.html

我想要比較兩個物種的XX＜＝＝但比較基礎是什麼呀？在生態、演化與系統分類領域的研究中，有一種題目一直是歷久不衰的，也就是. X與Y的比較"。我每次看到這種題目我就會問同學："X和Y的比較基礎是甚麼"？但是不少同學都無法回答。我不知道同學是否受到台灣媒體上那些動不動就把名人抓來比一比的影響，而不知道甚麼叫"比較基礎"。就好比你拿Jolin和周杰倫比身高、收入、緋聞數、專輯數、或寵物是沒有意義的，因為兩個人的性別不同，而性別在某些方面決定了努力的方向與市場訴求。所以有甚麼好比的？洪秀柱和蔡英文能比嗎？可以，因為兩人都是潛在的總統候選人。但是當她們兩個人不再是總統候選人時，就失去了除了性別以外的共通點，所以就沒甚麼好比的。菊科植物的棲位繁多，可能是草本、木本、藤本，可以是陸生也可以是水生的。如果有人做了一個題目，要比較＂氣孔形態＂，他可能就會去做一堆的電子顯微鏡觀察，然後呢，他一定會＂看到差異＂。但是請問看到...有袋類和真獸類之間有很多有意思的，因為趨同而產生的平行演化現象。所以我們可以比較鼴鼠和袋鼴鼠、鼯鼠和蜜袋鼯之間的差異嗎？他們很顯然沒有...訂閱：張貼留言 (Atom). 此課程為3學分,...

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系統分類學研究實務 & 系統生物學: 本學期課程進度

http://systematicbiology.blogspot.com/2012/03/3-16-01-0222-02-0229-03-0307-history-of.html

本課程是3學分課程, 共上16週(去掉期中末考所佔時間), 以下是本學期的上課時程與預定進度, 請各位留意:. 第03週: 03/07 The history of natural history. 第04週: 03/14 The beginning and the need of taxonomy. 第05週: 03/21 Principles of systematics. 第06週: 03/28 What is a species? 第07週: 04/04 Phylogenetic reconstruction: morphological characters. 第08週: 04/11 Phylogenetic reconstruction: molecular characters. 第09週: 04/18 Phylogenetic reconstruction: tree building. 第10週: 04/25 Phylogenetic reconstruction: comparing hypotheses. 第14週: 05/23 Biodiversity informatics.

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系統分類學研究實務 & 系統生物學: Caminalcules適合拿來當成支序學演算的練習題材嗎?

http://systematicbiology.blogspot.com/2014/05/caminalcules.html

堪薩斯大學的Joseph H. Sokal教授在1983年發表了四篇文章談一群假想生物的分類與演化，這群生物被稱為Caminalcules。而這系列假想生物也在日後成為許多大學教授系統發育與系統分類學重要的素材。然而在2014年的現在，回頭看Sokal的這個想法，其實有很多奇怪的地方。我這篇文章主要的用意就是告訴大家，如何看待Sokal當年的想法與理論背景，還有他的這些假想生物是否適合在高中生物與大學系統發育學中當成教材。如果不適合，為什麼？如果適合，應該怎麼做？ 1) 首先，請注意Sokal本身是數量分類學(numerical taxonomy)，也就是表型學派(phenetics)的支持者，而不是支序學派(cladistics)的學者。左邊這個圖經常出現在生物學課本中。anagenesis叫線性演化，而cladogenesis則是分支演化。線性演化的意思是說，新物種的形成是由祖先種直接變成子孫種，也就是說新物種的形成是漸變式的(gradualism)。而分支演化下的物種形成(speciation)則認為共祖會產生兩...那表型學派的物種形成觀點是線性還是分支？其實都不是&#12290...

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他是軟體動物雙殼綱的編輯，當他收到一些稿件使用mirror image來呈現物種的模式標本時，他就有此疑惑，所以想知道其它分類群編輯的看法。當然我們知道許多動物都是兩側對稱生物，但是難道因為是兩側對稱，所以使用mirror image就完全沒有問題嗎？在我看到的回覆意見中，多數的編輯都持反對的意見，理由如下：. 就算是兩側對稱動物，也可能會有不對稱結構，而不對稱結構在兩側對稱動物中所扮演的生理與生態功能一直是一個重大的議題。例如招潮蟹的螯、昆蟲的不對稱生殖器、魚類的不對稱口裂。也就是說，如果因為偷懶，或是為了自以為的畫面完美，而把一側鏡像到另一側來產生對稱影像，是不應該的；. 如果是標本本身破損，就應該忠實呈現破損的樣貌，而不應該為了自以為是的完美，而故意製造出鏡像，這樣反而會誤導讀者，更不要說使用鏡像來呈現原本並不完整的模式標本了；. 在這些狀況下使用鏡像，就涉及操控影像(manipulation of image)，屬於學術道德問題，應該直接退稿。我想要比較兩個物種的XX＜＝＝但比較基礎是什麼呀？ 12288;不行。因為牠們不具有最近的共祖，所以光是這樣比&#65292...菊科植物的棲位繁多&#...

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